《恶老板2》的故事紧接着第一集，Nick,Dale和Kurt这三个难兄难弟决定自己当老板，但是再次被狡猾的投资人欺骗。眼看着合同成了一纸空文，三人迫不得已决定绑架投资人的儿子，以重新夺回对公司的控制权……...

广袤而炎热的非洲大草原上，蓝色的小鹰阿凯（杰瑞米·苏雷斯JeremySuarez配音）在天空中自由翱翔，他从父亲（塞缪尔·杰克逊SamuelL.Jackson配音）那里接受了严格的训练，如今羽翼已丰的小家伙渴望成为一个超越父亲的飞行高手。阿凯对贫瘠的卡吐姆峡谷感到厌倦，也不愿意毕生成为只为了生计奔波的蜥蜴猎手，他渴望一场惊险刺激的冒险。这一天，疲劳的鞍嘴鹳果果带着几只刚刚破壳的绿头金织鸟路过阿凯的...

悍娇虎（凯瑞·华格伦配音）少女时候跟着师傅（达斯汀·霍夫曼配音）辛苦练功，却始终无法得到师傅的认可。终于有一天，强敌野猪来袭，打败了一众高手，几乎无人能敌。混血大师被击败后来到翡翠宫找师傅，希望师傅能阻止野猪，于是师傅答应接受挑战。可是就在比武的前几天，师傅因为吃了阿波（杰克·布莱克配音）做的饭而食物中毒无法应战，无奈之下指派悍娇虎带着卷轴去寻找神奇四侠，一连串的巧合之下，悍娇虎带回了快螳螂等人，...

中世纪一个聚集着精灵的小山村，正义的魔法师卡尔多夫（吉姆·库宁斯JimCummings配音）驱逐了邪恶而法术高强的女巫德里泽达（薇姬·刘易斯VickiLewis配音）。德里泽达无法匹敌，恨恨逃走，而她那不谙世事、单纯善良的侄女雅典娜（凯莉·斯泰堡丝KellyStables配音）则获准留了下来。在此期间，雅典娜还收养了小猫汤姆和老鼠杰瑞。雅典娜敏感的身份以及经常惹祸的猫和老鼠，让女孩一直遭受精灵们的...